非法持有属于国家绝密、机密的文件、资料或者其他物品，拒不说明来源罪与泄露国家秘密罪的区别是：一是犯罪主体不同。前者是一般主体，后者是特殊主体和一般主体。二是犯罪主观方面也不同。前者是属于故意，后者既可以是故意也可以是过失。三是犯罪客体不同。前者犯罪的客体是公共秩序，后者犯罪的客体是国家机关的正常管理活动。四是客观方面不同。前者是“持有型”的犯罪，后者是有泄露国家秘密的结果，属于结果犯。如果行为人实施了上述两种犯罪行为，则实行数罪并罚。
所谓“拒不说明”来源和用途，是指经调查询问仍不肯说明所非法持有的绝密、机密的文件、资料或者其他物品从何处获取，在什么方面或范围使用。
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